军运村站基坑标准段深度约14.6m，盾构井段基坑深度为16.2m，采用D1200@1500mm钻孔灌注桩作为车站主体围护结构。主体基坑标准段采用竖向设置三道支撑，其中第一道支撑采用800×1000mm混凝土支撑，间距9米；第二道钢支撑采用D=800mm，壁厚16mm的钢管支撑，第三道钢支撑采用D=600mm，壁厚16mm的钢管支撑，钢支撑间距3米。